Školní docházka na základní škole je rozčleněna do tří cyklů ( Prvotní výuka, Základy vzdělání a pokračovací cyklus). Díky tomu může být průběh výuky více přizpůsobován potřebám každého žáka.
Plynulý přechod mezi mateřskou a základní školou, později pak mezi základní školou a druhým stupněm (Collège) umožňuje zajistit kontinuitu výukových programů a je jednou z podmínek zdárného průběhu školní docházky. V závěru každého cyklu má žák mít osvojen určitý soubor kompetencí - znalostí a dovedností.

Nejmenší oddělení mateřské školy pro děti od dvou let (třída TPS)

Nefrankofonní žáci

  Jedním ze specifik Francouzského lycea v Praze je integrace nefrankofonních žáků na všech úrovních základní školy . Tito žáci, kromě toho,že se účastní práce ve třídě pod vedením třídního učitele, jsou od začátku v péči pedagožky, jejíž specializací je francouzština jako vyučovací jazyk. Učí žáky ovládnout základy jazyka tak, aby mohli začít brzy komunikovat a co nejrychleji se začlenit do výuky ve své třídě.

Počátkem školního roku jsou organizovány informativní třídní schůzky. V průběhu roku pak mohou být další schůzky v některých třídách, pokud je třeba předat rodičům informace např. o aktuálním projektu
(školy v přírodě) nebo o individuální péči, která je některým dětem v odůvodněných případech věnována (Individuální projekt pro zlepšení prospěchu - tzv. PPRE).

Hodnocení probíhá na základní škole průběžně. Rodiče mohou být kdykoliv informováni o okamžité situaci svého dítěte. Vždy koncem trimestru jsou jim předávány hodnotící dokumenty ve formě brožur, kde mohou podrobně sledovat, jakých pokroků a jaké úrovně dítě dosáhlo. Koncem 2.ročníku ( třída CE1) a v lednu v 5.ročníku (/třída CM2)absolvují všichni žáci celostátní srovnávací testy, o jejichž výsledcích jsou rodiče informování osobně ředitelem nebo třídním učitelem.
V pátek odpoledne jsou do rozvrhu zařazeny hodiny individuální podpory, které jsou určeny vybraným žákům podle jejich potřeb, na základě návrhu pedagogické rady cyklu. Tyto hodiny mohou být nárazovou nebo déletrvající pomocí ( od dvou až tří do např. šesti po sobě jdoucích lekcí). Rodiče jsou o návrhu informování předem a požádáni o souhlas.
Žáci, jejichž mateřským jazykem je čeština, mají tři hodiny týdně kurs českého jazyka, zaměřený tak, aby
vyhověli požadavkům české školy pro příslušný ročník. Ostatní žáci se učí český jazyk pro cizince od 1.ročníku (CP): 1 hodinu týdně v CP, v dalších ročnících 2 hodiny týdně.
Po celou dobu docházky do elementární školy je věnována zvýšená pozornost žákům, jejichž mateřským jazykem není francouzština, a v případě potřeby je jim poskytována odborná podpora.
Ke konci závěrečného cyklu mají žáci možnost složit zkoušku z anglického jazyka, organizovanou Francouzským lyceem ve spolupráci s Cambridge University.